El Centro nace en 2011 como iniciativa conjunta entre la Universidad, el Gobierno Regional de Valparaíso (GORE), la Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica (CONICYT), empresa Quintil S.A. como asociada regional y el apoyo de las agrícolas Brown y Pihué.

A través del modelo que CERES impulsa, se busca generar bienestar para las comunidades, a partir de la producción de alimentos diversos, inocuos y saludables, provenientes de sistemas agrícolas equilibrados, basados en policultivos, que prescinden del uso de pesticidas y de fertilizantes químicos o de síntesis. De esta manera, se restaura la biología y fertilidad natural de los suelos, el uso eficiente del agua y la conservando de la biodiversidad de especies vegetales.

Busca generar propuestas para el ordenamiento territorial, que permitan un desarrollo armónico de los territorios rurales y la conservación dinámica de los paisajes y del patrimonio natural, permitiendo así generar valor agregado a los productos, conservar zonas perimetrales de las ciudades, y la protección de los suelos, de valor agrícola en desmedro al uso urbano.